Super Mario Maker для Nintendo 3DS - это порт игры Super Mario Maker для Wii U, позволяющий игрокам создавать и играть в собственные уровни платформенной игры Mario, а также проходить многие другие, созданные ранее. Наиболее радикальное отличие этой игры от оригинала заключается в том, что версия для 3DS не позволяет игрокам загружать созданные ими уровни в Интернет. Однако игроки могут делиться своими курсами друг с другом через StreetPass или Local Play. В комплект игры входит 100 эксклюзивных курсов, которых нет в версии для Wii U. Эти курсы имеют различные цели (например, собрать все монеты на уровне), по завершении которых игрок получает медали. Почти все остальные аспекты игры остались такими же, как и в версии для Wii U, за исключением некоторых деталей, таких как отсутствие некоторых мелких элементов (например, больших грибов и мини-игры Gnat Attack). Несмотря на то, что это игра для 3DS, в ней нет стереоскопического 3D.