Вы становитесь тренером покемонов, путешествуя из города в город по региону Джото в поисках приключений, чтобы ловить, обучать и сражаться с покемонами. Вы можете взять с собой любимого покемона куда угодно, используя новый аксессуар Pokewalker; перенесите покемона в Pokewalker по беспроводной сети и проведите своего покемона по виртуальным маршрутам, пока вы гуляете в реальной жизни. Прогуливаясь, вы зарабатываете Ватты, которые можно использовать для встречи и ловли диких покемонов или поиска спрятанных предметов; Покемон в Pokewalker будет получать очки опыта во время ходьбы и даже может подняться на один уровень, когда покемон будет перенесен обратно в игру. Впервые любой покемон может следовать за вами в вашем путешествии за пределы PokeBall; ваш любимый покемон всегда может быть рядом с вами. Благодаря беспроводному широкополосному соединению вы можете взаимодействовать со своими друзьями, у которых есть игра Pokemon HeartGold или SoulSilver Version, для обмена покемонами или сражений с ними через службу Nintendo Wi-Fi Connection; вы также можете сражаться и торговать с другими людьми через локальное беспроводное соединение. Внутренние часы отслеживают время суток и день недели; некоторые особые события будут происходить только в определенные дни или в определенное время суток.